（4）以空穴作用层次为分类的依据
我们能够凭是什么层次粒子的空穴来作为确定粒子层次的依据来对粒子的分类。
以什么层次粒子的空穴来作为确定粒子层次的依据，在确定粒子的层次之前就已经确定了粒子层次的概念了，这似乎是循环定义，这样的定义科学合理吗？根据“科学小舟新科学”的“认识源自类比”思想，人类只有明确了参照物、有了可类比的东西，对世界才能形成形象的认识，世上没有绝对的东西，这就包括了对粒子层次分类的情况，所谓层次就是对比的结果，如果没有了对比也就没有了层次的分类，我们只有采用参照的方法才能形成形象的观念，只有确定了是以哪种粒子为标准，在参照这类粒子的大小的情况下，其他粒子的层次才能比较出来。所以我们就可以先命名能吸引最小的粒子是什么类型，与之对应的空穴就是“某某子空穴”，那么就可以以“某某粒子空穴物质”命名这个凝聚物了，比如可以先命名与光现象密切相关的粒子空穴为“光子空穴”、与电现象密切相关的粒子空穴为“电子空穴”……那么就可以将能吸引电子、磁子、光子……的空穴所形成的凝聚物命名为“光子空穴物质”、“电子空穴物质”。那么因为原子结构中有光子，所以原子也可以看作是光子的空穴起到了作用，因为每种粒子在空间含量的空穴都能形成有一定大小的粒子，形成这种一定大小的粒子“光子空穴粒子”我们就可以命名为 “电子”或“热子”。现代科学中已经有类似性质的粒子命名，我们当然是尽量取相同的名字为好，以此方便让“科学小舟新科学”与现代科学能接轨并过渡。
相同一类原子，会因为空间中含有的光子、磁子、电子存在情况而形成不同性质的原子，根据空间的粒子的不同组成，在理想状态下，原子又可以分以下类型，一种是“纯粒子空穴”：“纯光子空穴”原子、“纯磁子空穴”原子、“纯电子空穴”原子；另一类是“非纯粒子空穴”：“光子+磁子空穴”原子、“光子+电子空穴”原子、“磁子+电子空穴”原子；“非纯粒子空穴”又包含了三种