在进行物质元素分类之前我们必须明确元素的定义是什么？正如前面对热子和原子定义一样，能成为元素周期表的元素，条件必然是单个同层空穴所形成的“基本粒子”，如果将多个空穴形成的粒子也定义为相同元素，那么这样的分类是无意义的。比如由超过了两个电子空穴形成的一个或多个氢热子（氢在“科学小舟新科学”里归类为热子层次的粒子，比原子小一级）和若干电子结合成的凝聚物就不能作为特定的基本粒子（原子），而是成为 “多电子空穴态物质” —-它是既非热子又非原子的物质，“分子态物质”对于原子来说既非热子，也非原子。如图：
（多电子空穴物质）
希望大家在阅读下面的内容能先深刻理解“4粒子8结构规律”以及热子、原子等基本粒子定义的含义，以便这里能更好地理解“科学小舟新科学”对人类物质元素分类的方法。“科学小舟新科学”对人类物质元素分类方法是：将具有相同的热子数量和结构归于相同元素族，而以组成热子含有的不同电子数量和结构与其所在的族共同确定物质元素种类。
这里我们首先确定氢在我们这个“科学小舟新科学”的元素周期表的位置，在“热子的基本结构类型”章节中已经分析了氢是热子而不是原子的原因，也阐述了把氢作为新旧科学粒子衔接的桥梁作用，如图：
根据以上对基本粒子的分析，可见现代科学将小至1-H氢元素大至103-Lr铹元素的粒子都称为原子，这就存在对粒子层次认识的模糊，就像如果我们一开始将大分子团、分子以及金属原子都定义为“分子”一样，虽然不能说是错误的，但也至少可以说是笼统的、不科学的。事实上这前面提到的氢跟碳被人们都归为一类的粒子并都称之为原子，其实是两个层次的粒子。原因这里再解释下，因为假如现在元素周期表中的“氢”元素就是人类物质中“最小质量的元素粒子”，那么根据前面总结的科学小舟“4粒子8结构规律”可知，“氢”元素粒子就必定是参照4个更小层次“电子”作为骨架粒子构成的最小粒子，氢原子在现代科学中的原子量是1，那么电子对应的原子量就是1/4.75（4个骨架电子+3个封堵磁子，封堵磁子算0.75个电子），能组成“热子”最大的骨架粒子极限是17个“电子”（参照热子结构的D族热子，组成热子的骨架粒子是电子），所以在物质世界里不可能存在相同层次而质量相差如此之远的 “同层粒子”—即所谓的原子！因此我们知道，现代科学中的元素周期表的“1H氢”和“4He氦”等元素与原子量超过“（17+5）/5的元素”并不是同一层次的粒子！即是原子量低于22/5